报告人:吴红艳(中国科学院深圳先进技术研究院)
时间:2023年10月19日 08:00-12:00
地址:第一教学楼D1225
摘要:图模型无处不在,可以建模包括互作、空间以及时间在内的重要关系,涉及到几乎所有的学科领域。面对图多样性强、缺乏领域知识以及深度学习模型的黑盒性的挑战,如何提高图计算模型在药物发现领域的精准度,并使得模型具有实践指导意义具有迫切的研究意义。本次报告将详细介绍课题组在图计算优化算法及其在大、小分子药物筛选方面的工作,主要包括:图的过/欠平滑意识自适应模型(Smoothness Sensor),预测抗原抗体相互作用的大分子药物筛选模型(DeepAAI),以及小分子药物优化模型(Graph Polish)等。
简介:吴红艳,中国科学院深圳先进技术研究院高级工程师,博士生导师。深圳市“孔雀计划”海外高层次人才。2011年在东京大学获得博士学位,2011至2015年在日本信息系统研究所生命科学数据库中心(ROIS·DBCLS),担任数据库集成高级技术专家,负责包括DDBJ(三大基因序列数据库之一)在内的全日本生命科学数据的集成融合及工具研发。2016年加入深圳市先进技术研究院,致力于深度图计算算法,以及图计算在健康大数据分析、生命科学领域多组学数据融合等多种场景下的应用,研究提升深度学习模型在多种应用场景的预测精度、泛化性及可解释性。主持国自然面上和青年科学基金项目,核心参与的“深圳卫生信息大数据平台构建及应用”获深圳科技进步二等奖,以第一或通讯作者在Nature Machine Intelligence,IEEE Trans Neural Netw Learn Syst, IEEE Trans Cybernetics,Briefings in Bioinformatics 等重要国际期刊发表论文30余篇;申请专利和软著40余项。
邀请人:何光辉
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